• Thursday June 20,2019

Kategori - human genetikk


Ras: kanskje det er jordbruk

Ras: kanskje det er jordbruk

Jeg er for opptatt til å blogge virkelig i dag, men jeg tenkte på å sette opp et innlegg, som i sin helhet ble uttrykt i Ians kommentar nedenfor: Da jeg var yngre, tenkte jeg på menneskelige raser som arketyper, og variasjonen mellom dem var et produkt av blanding. Jeg skylder på det faktum at jeg leste Coon da jeg var om 14. Lik

De fleste mtDNA-linjene utvidet før den neolitiske?

De fleste mtDNA-linjene utvidet før den neolitiske?

En ny kort kommunikasjon i Scientific Reports antyder at den mest demografiske ekspansjonen som ble funnet ved hjelp av mtDNA, skjedde før den neolitiske. MtDNA analyse av globale populasjoner støtter at store befolkningsutvidelser begynte før neolitisk tid: Landbruk resulterte i omfattende befolkningsvekst og menneskelige aktiviteter. M

Rekonstruere genetiske krusninger i tid og rom

Rekonstruere genetiske krusninger i tid og rom

Den uendelige Joe Pickrell har falt sin Khoisan-er-del-italiensk preprint til arXiv, gamle vest-eurasiske aner i Sør-og Øst-Afrika. Jeg er glad i min karakterisering av papirets kjernekonklusjon, men det er grunnen til et slikt flipprespons: de påvirkninger han ser ut til å trekke ut fra de genetiske dataene, slår meg til å bli gal . Men

Merina av Madagaskar er malaysisk og bantu

Merina av Madagaskar er malaysisk og bantu

For en måned siden ba jeg om en malagasisk genotype. Nesten umiddelbart mottok jeg et svar fra noen som var 33% malagasisk. Mer nylig har jeg sendt et genotyping kit til noen som er malagasisk. Disse resultatene skal komme inn innen en måned eller så. Men for noen dager siden fikk jeg en kontakt fra en person fra den Merina-etniske gruppen av høylandet Madagaskar. Så

Human genetikk presentasjoner av interesse

Human genetikk presentasjoner av interesse

Dienekes varsler meg om at den internasjonale kongressen for human genetikk abstrakter er online. Jeg tilbrakte en time med bare noen få søkeord, og kom opp med mye. 1) Hvis du har en presentasjon og tror det kan være interessant for leserne her, vær så snill å slippe en link inn (jeg vil se i spammappen mer i dag, selv om en lenke ikke burde være gal). 2) Hv

Bruk dine 23andMe data: hvordan innavlet er du?

Bruk dine 23andMe data: hvordan innavlet er du?

Tidligere utgaver: Bruke dine 23andMe-data: utforske med MDS Bruk din 23andMe data i Plink Fra Rekonstruere Indisk Befolkningshistorie: . Vi antar at grunnleggereffekter er ansvarlige for en enda høyere byrde av recessive sykdommer i India enn konsanguinitet . For å teste denne hypotesen brukte vi dataene våre til å estimere sannsynligheten for at to alleler fra en gruppe deler en felles forfedre nylig enn den gruppens divergens fra andre indianere, og sammenlignet dette med sannsynligheten for at en persons to alleler dele en forfedre i de siste få generasjoner på grunn av blodproblemer. Ni a

Privilegene og byrdene til en ny inversjon

Privilegene og byrdene til en ny inversjon

Det er to artikler i naturgenetikk på 17q21.31, og variasjon av haplotyper av inversjoner i verdensomspennende populasjoner. Her er en del av diskusjonen fra det første papiret: Til slutt foreslår vi at den forfedre H2'-haplotypen oppstod i østlige eller sentrale Afrika og spredte seg til Sør-Afrika før fremveksten av anatomisk moderne mennesker. For

Anglosphere Amerikansk unntak (?)

Anglosphere Amerikansk unntak (?)

PLoS ONE har en annen artikkel om blanding i Argentina. Det interessante aspektet er at i sin selvoppfattelse er Argentina, som USA eller Australia, en europeisk bosetternasjon , og derfor, i motsetning til Mexico, Boliva eller Brasil, hver av dem eid eller de facto fremmer en flerkulturell og multiracial identitet

Samtykke og genomikk

Samtykke og genomikk

Interessant historie i New York Times , Genes Now, Tell Doctor Secrets De kan ikke utter: Et av de første tilfellene kom for ti år siden, akkurat som den nye alderen av genetikk begynte. En ung kvinne med en sterk familiehistorie av brystkreft og eggstokkreft som er registrert i en studie som prøver å finne kreftgener som, når de er muterte, øker risikoen for brystkreft sterkt. Men

 "Manglende arvelighet " - interaksjonsutgave

"Manglende arvelighet " - interaksjonsutgave

Pith: En stor del viktige medisinske genetiske forskjeller mellom mennesker kan skyldes arten av vekselvirkninger av genetiske varianter. Hvis du har lest denne bloggen en stund, vet du at det er et spørsmål i genomics akkurat nå som å "savne ærlighet". Problemet er i utgangspunktet at det er trekk der arvsmønstre innebærer at det meste av Variasjonen skyldes gener, men forsøk på å finne ut hvilke spesifikke genetiske varianter som er ansvarlige for denne varianten, har ikke gitt mye. For ekse

Ingen våger å kalle det eugenikk!

Ingen våger å kalle det eugenikk!

Vel, nesten ingen: "Den uuttalte sentrale årsaken til samfunnsmessig tabu og straffeforbud mot incest er muligheten for arvelige mangler - en faktor som Strasbourg bare antyder. Men hensikten bak det eugeniske argumentet er en som er uforsvarlig, og ikke bare i Tyskland med sin forferdelige nazistiske fortid: Den økte risikoen for arvelige mangler begrunner ikke et lovlig forbud.

Genetisk særpreg mot genetisk mangfold

Genetisk særpreg mot genetisk mangfold

Møter Taino I kommentarene nedenfor for noen dager siden uttrykte noen bekymring for å redusere genetisk mangfold på grunn av at urbefolkningen forsvinner. Mitt svar var bascally at det avhenger. Problemet her er om den forsvinden skyldes assimilering eller utryddelse. Hvis en gitt befolkning er genetisk absorbert i en annen, er deres genetiske mangfold åpenbart opprettholdt. De

GIF av genomics

GIF av genomics

Som du kanskje vet har det interminable Myriad genetics patent saken gjort bølger i domstolene, senest med blandede resultater om deres patenter på flere spesifikke genetiske diagnostikk er gyldige. Dette aspektet må utheves: En av de tre avgjørende dommerne, William Bryson, avviger delvis fra flertallet, og hevder at Myriads krav til BRCA-genet og genfragmentene ikke er gyldige. Ha

Gener i rommet

Gener i rommet

Fra noen av de samme menneskene som brakte deg det genetiske kartet over Europa, et veldig viktig papir, En modellbasert tilnærming til analyse av romlig struktur i genetiske data. Her er det abstrakte: Karakterisering av genetisk mangfold i og mellom populasjoner har brede anvendelser i studier av menneskelig sykdom og evolusjon.

Breddegrader og lengder og sfæriske kyr

Breddegrader og lengder og sfæriske kyr

Et nytt papir i The American Journal of Physical Anthropology undersøker variasjonen av gener over breddegrader og lengder. Forfatterne fant at både breddegrad og lengdegrad var signifikant i Amerika, mens bare breddegrad var betydelig i Eurasia. De brukte mikrosatellitter, som er greit for meg. Hovedproblemet som de anerkjenner er at deres prøvetaking av populasjoner er ganske sparsom i enkelte områder. La

Europas spesielle nordøst

Europas spesielle nordøst

Fennoscandia-prosjektet har nå gått gjennom kromosomer 1 til 6 med Chromopainter / fineSTRUCTURE. Konklusjonen: Hvis vi ser på det større bildet, ser vi at det meste av det kontinentale Europa er bundet til hverandre mer gjennomgående mutasjoner enn andre som gjør dem vanskeligere å skille selv på dette nivået (6 kromosomer). Vi ser

Et mongolsk genom?

Et mongolsk genom?

Vel, ikke helt. Du må lese papiret, genomisk analyse av naturlig utvelgelse og fenotypisk variasjon i Mongolier med høy høyde, for å se hvorfor jeg er skeptisk. Helt ærlig synes det ikke som om de fant for mye oppmerksomhet i resultatene deres, så jeg er litt forvirret hvorfor dette papiret kom inn i PLOS GENETICS (og for å gi behørig kreditt, har denne gruppen publisert svært interessant arbeid tidligere som jeg har smilte på). Så hvorf

Signal av Indo-Aryan blanding i South Indian Brahmins

Signal av Indo-Aryan blanding i South Indian Brahmins

Jeg har nevnt noen ganger at Reich lab har funnet suggestive bevis for blanding mellom urfolk sydasere og en vest-eurasisk gruppe i størrelsesorden 3.000 år før nåtiden. Den modale forklaringen er trolig en indo-arisk inntrenging. Dienekes brukte rolloff i ADMIXTOOLS for å gjenta disse generelle funnene. Nær

Gener er sannsynlighet, ikke skjebne

Gener er sannsynlighet, ikke skjebne

På min Facebook-feed passerte noen genetiske venner av meg om en artikkel i The New York Times . Studien sier at DNAs makt til å forutsi sykdom er begrenset. Artikkelen er basert på et papir, The Predictive Capacity of Personal Genome Sequencing. I sin tur er dette papiret, samt oppskrivningen i The New York Times , blitt kritisert mye i genomforsknings- og genetikksamfunnet. P

Hvorfor melanesere er blonde løst?

Hvorfor melanesere er blonde løst?

Sorter av og mulig. Jeg har snakket om dette i årevis, og Greg Cochran peker meg på et abstrakt på den menneskelige genetikk konferansen som tidligere referert. Nylig kodende variasjon ved TYRP1 forklarer en stor del av variansen i Solomon Islanders hårfarge: Solomon-skjærgården består av over 1000 øyer lokalisert øst for Papua Ny Guinea, og har en befolkning kjent for stor variasjon i hårpigmentering. 1200 prø